根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第六十八条规定，公安机关对违法所得财物应当在侦查终结后移交人民检察院或者人民法院。此外，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第九十五条规定，被告人承担保全义务的案件，公安机关应当将查封、冻结、扣押的财物交由公安机关所属的银行、保险、证券、基金监督管理机构保管。被告人提供保全财产的担保，应当提供担保财产清单并经人民检察院或者人民法院确认。
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第六十八条规定，公安机关对违法所得财物应当在侦查终结后移交人民检察院或者人民法院。因此，公安机关暂扣的款项应当随案移交给相关的法律机构。
此外，根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第九十五条规定，被告人承担保全义务的案件，公安机关应当将查封、冻结、扣押的财物交由公安机关所属的银行、保险、证券、基金监督管理机构保管。被告人提供保全财产的担保，应当提供担保财产清单并经人民检察院或者人民法院确认。
综上所述，公安机关暂扣款项应当在案件侦查终结后移交给相关的法律机构，并根据相关规定进行保管和处理。具体的公安暂扣款规定可能还需要参考相关部门发布的具体规定。