如果申请人对鉴定结果有异议，可以通过合法途径提出抗诉。法院将依据鉴定意见、相关证据和法律规定进行判决，决定最终的赔偿金额。
道路交通事故的伤残鉴定程序主要包括以下几个步骤：
1. 报案和现场勘查：当一起事故发生时，相关当事人应第一时间报案，并由交通警察到案发现场进行现场勘查，采集相关证据和现场情况。
2. 医院诊断和报告：伤者应尽快前往医院接受诊断和治疗，医生将开具相应的医疗报告，记录伤者的伤情和医疗情况。
3. 申请鉴定：伤者或其法定代理人需要向司法鉴定机构提出申请，包括提交相关的证据材料，如医疗报告、病历、病案等。
4. 鉴定程序：司法鉴定机构会根据申请人提供的材料进行伤残的鉴定工作。具体鉴定程序包括：接受申请、审核申请材料、组织鉴定人员进行鉴定、出具鉴定意见。
5. 鉴定意见和抗诉权：司法鉴定机构根据实际情况鉴定出伤残程度，并将鉴定结果以书面形式告知申请人。如果申请人对鉴定结果有异议，可以通过合法途径提出抗诉。
6. 法院裁决：如果申请人和事故责任方之间存在争议，任何一方都可以将争议提交给法院解决。法院将依据鉴定意见、相关证据和法律规定进行判决，决定最终的赔偿金额。
需要注意的是，不同国家和地区可能会对伤残鉴定程序有所不同，请根据当地法律法规进行相关程序的办理。